Как считаем
- Проверяем идентификаторы, единицы, обработку, состояние, время и контроли.
- Технические повторы сводим внутри образца. Доли — по сумме числителей и знаменателей. Затем усредняем образцы внутри независимой единицы.
- Для каждой пары: Δ = опыт − контроль, R = опыт / контроль. При неподходящем знаменателе отношение не считается.
- Если есть подсчёт в том же sample_id: сигнал / число клеток × 1000. Для секреции это нормализация конечной концентрации, не скорость.
- Повторные серии одного biological_replicate_id усредняются до сводки. Показываем среднее, SD, отдельные точки и исследовательский bootstrap-интервал.