CellFate · Как работает
Снижение сигнала — ещё не объяснение. CellFate помогает понять, что изменилось в опыте, какие выводы поддержаны измерениями и чего пока не хватает.
Посмотреть учебный пример ↗Клеточная модель
Фибробласты или онкологическая клеточная модель? Укажите линию, состояние клеток и задачу опыта. От этого зависит, какие сравнения имеют смысл.
Фибробласты человека; в онкологии — установленные человеческие линии в 2D-монокультуре. Органоиды и клинические образцы не считаются проверенными сценариями.
Исходные измерения
CSV, Excel или сохранённый JSON. Сопоставьте колонки, отметьте контроль, дозу, время и независимые повторы. Уже обработанные значения фибробластов открываются в отдельном режиме.
Технические лунки не становятся независимыми опытами. Средние, SD и SEM остаются разными величинами.
Качество данных
CellFate проверяет структуру таблицы, пропуски и условия сравнения. Для парного анализа важны связи между контролем и воздействием внутри одного независимого повтора.
Если нет исходного числа клеток — нет GR. Если нет прямого наблюдения событий — нельзя вычислить частоты деления и гибели. Недостающие измерения не достраиваются.
Сигнал и число клеток
Сравниваем число живых клеток и энергетический сигнал отдельно. При подходящих парных измерениях нормализуем сигнал на число клеток. Так становится видно, насколько падение сигнала связано с потерей клеток.
В учебном сравнении осталось 50% клеток и 40% ATP: ATP на клетку составляет 80% от контроля. В реальном анализе отношения сначала считаются внутри независимых повторов.
Доза и время
Выберите условие, канал и время. Рассмотрите наблюдаемые значения, контроль и разброс повторов. В онкологии при подходящих исходных данных доступна поправка GR на скорость роста.
Линия между измеренными точками помогает читать график. Она не прогнозирует следующий срок. Ровное число клеток само по себе не отделяет остановку деления от равновесия деления и гибели.
Метод под задачу
Есть прямые события трекинга — анализируем деление и гибель. Есть первые исходы с неполными наблюдениями — используем соответствующий режим. Есть матрица сочетаний — сравниваем её с эталонами Bliss и HSA.
В схеме справа: A = 80%, B = 70% живых клеток от контроля. Bliss ожидает 56%, в комбинации измерено 45%; контраст — 11 процентных пунктов. Это не доказательство механизма или лечебной эффективности.
Воспроизводимый результат
Графики, численные итоги, паспорт опыта и ограничения остаются в отчёте. Архив содержит исходный проект, результат, расчётный код и контрольные суммы — расчёт можно повторить.
«Мои проекты» CellFate сохраняются в этом браузере. Для переноса скачайте JSON. Отчёт помогает выбрать следующий исследовательский вопрос, но не назначает лечение.
Что можно утверждать
Сервис не превращает ATP в доказательство гибели, сходство кривых — в механизм действия, а снижение числа опухолевых клеток — в рекомендацию по лечению. Доступный вывод зависит от измерений и устройства опыта.
Методы, источники и границы применения ↗Фибробласты, онкологический ответ, динамика и комбинации. Готовые примеры открываются без регистрации.
Выбрать пример ↗